Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ52

CHPF, Chondroitin sulfate synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPFQ8IZ52 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHPFQ8IZ52 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPFQ8IZ52 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPFQ8IZ52 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPFQ8IZ52 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPFQ8IZ52 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPFQ8IZ52 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPFQ8IZ52 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHPFQ8IZ52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHPFQ8IZ52 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPFQ8IZ52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHPFQ8IZ52 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHPFQ8IZ52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHPFQ8IZ52 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHPFQ8IZ52 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPFQ8IZ52 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHPFQ8IZ52 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHPFQ8IZ52 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms