Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y46

KRT73, Keratin, type II cytoskeletal 73, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT73Q86Y46 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT73Q86Y46 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT73Q86Y46 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT73Q86Y46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT73Q86Y46 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT73Q86Y46 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT73Q86Y46 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT73Q86Y46 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT73Q86Y46 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT73Q86Y46 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT73Q86Y46 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT73Q86Y46 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT73Q86Y46 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT73Q86Y46 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT73Q86Y46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms