Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms