Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASSF3Q86WH2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RASSF3Q86WH2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RASSF3Q86WH2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RASSF3Q86WH2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASSF3Q86WH2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RASSF3Q86WH2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RASSF3Q86WH2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RASSF3Q86WH2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms