Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FAM228AQ86W67 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM228AQ86W67 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FAM228AQ86W67 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM228AQ86W67 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM228AQ86W67 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FAM228AQ86W67 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FAM228AQ86W67 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FAM228AQ86W67 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM228AQ86W67 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FAM228AQ86W67 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FAM228AQ86W67 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FAM228AQ86W67 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM228AQ86W67 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM228AQ86W67 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM228AQ86W67 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FAM228AQ86W67 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FAM228AQ86W67 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FAM228AQ86W67 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FAM228AQ86W67 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FAM228AQ86W67 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FAM228AQ86W67 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FAM228AQ86W67 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FAM228AQ86W67 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms