Protein–RNA interactions for Protein: Q86UD5

SLC9B2, Sodium/hydrogen exchanger 9B2, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B2Q86UD5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9B2Q86UD5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9B2Q86UD5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC9B2Q86UD5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9B2Q86UD5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC9B2Q86UD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9B2Q86UD5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC9B2Q86UD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC9B2Q86UD5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9B2Q86UD5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC9B2Q86UD5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC9B2Q86UD5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC9B2Q86UD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC9B2Q86UD5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC9B2Q86UD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC9B2Q86UD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC9B2Q86UD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC9B2Q86UD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC9B2Q86UD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms