Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SZRD1Q7Z422 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SZRD1Q7Z422 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SZRD1Q7Z422 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SZRD1Q7Z422 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SZRD1Q7Z422 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SZRD1Q7Z422 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SZRD1Q7Z422 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SZRD1Q7Z422 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SZRD1Q7Z422 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SZRD1Q7Z422 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SZRD1Q7Z422 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SZRD1Q7Z422 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SZRD1Q7Z422 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SZRD1Q7Z422 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SZRD1Q7Z422 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SZRD1Q7Z422 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SZRD1Q7Z422 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SZRD1Q7Z422 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SZRD1Q7Z422 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SZRD1Q7Z422 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms