Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3D4

LYSMD3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSMD3Q7Z3D4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LYSMD3Q7Z3D4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LYSMD3Q7Z3D4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LYSMD3Q7Z3D4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LYSMD3Q7Z3D4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LYSMD3Q7Z3D4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LYSMD3Q7Z3D4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LYSMD3Q7Z3D4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LYSMD3Q7Z3D4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LYSMD3Q7Z3D4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LYSMD3Q7Z3D4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LYSMD3Q7Z3D4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LYSMD3Q7Z3D4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LYSMD3Q7Z3D4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LYSMD3Q7Z3D4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LYSMD3Q7Z3D4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LYSMD3Q7Z3D4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LYSMD3Q7Z3D4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LYSMD3Q7Z3D4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LYSMD3Q7Z3D4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LYSMD3Q7Z3D4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LYSMD3Q7Z3D4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms