Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NLRP9Q7RTR0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP9Q7RTR0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP9Q7RTR0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP9Q7RTR0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP9Q7RTR0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP9Q7RTR0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP9Q7RTR0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP9Q7RTR0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP9Q7RTR0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRP9Q7RTR0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP9Q7RTR0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP9Q7RTR0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP9Q7RTR0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP9Q7RTR0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP9Q7RTR0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP9Q7RTR0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRP9Q7RTR0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NLRP9Q7RTR0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NLRP9Q7RTR0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NLRP9Q7RTR0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NLRP9Q7RTR0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NLRP9Q7RTR0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms