Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDZD4Q76G19 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDZD4Q76G19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZD4Q76G19 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PDZD4Q76G19 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZD4Q76G19 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZD4Q76G19 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZD4Q76G19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZD4Q76G19 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZD4Q76G19 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZD4Q76G19 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZD4Q76G19 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZD4Q76G19 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDZD4Q76G19 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDZD4Q76G19 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDZD4Q76G19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDZD4Q76G19 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms