Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIAA1549LQ6ZVL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIAA1549LQ6ZVL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KIAA1549LQ6ZVL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA1549LQ6ZVL6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA1549LQ6ZVL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIAA1549LQ6ZVL6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIAA1549LQ6ZVL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KIAA1549LQ6ZVL6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KIAA1549LQ6ZVL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIAA1549LQ6ZVL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KIAA1549LQ6ZVL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIAA1549LQ6ZVL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms