Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SUSD1Q6UWL2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUSD1Q6UWL2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD1Q6UWL2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD1Q6UWL2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD1Q6UWL2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD1Q6UWL2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD1Q6UWL2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD1Q6UWL2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUSD1Q6UWL2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SUSD1Q6UWL2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SUSD1Q6UWL2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SUSD1Q6UWL2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SUSD1Q6UWL2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD1Q6UWL2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD1Q6UWL2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SUSD1Q6UWL2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD1Q6UWL2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUSD1Q6UWL2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUSD1Q6UWL2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SUSD1Q6UWL2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms