Protein–RNA interactions for Protein: Q6RSH7

VHLL, von Hippel-Lindau-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLLQ6RSH7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VHLLQ6RSH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VHLLQ6RSH7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VHLLQ6RSH7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VHLLQ6RSH7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLLQ6RSH7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VHLLQ6RSH7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VHLLQ6RSH7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VHLLQ6RSH7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VHLLQ6RSH7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VHLLQ6RSH7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VHLLQ6RSH7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VHLLQ6RSH7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VHLLQ6RSH7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLLQ6RSH7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms