Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCTN3Q6NUS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCTN3Q6NUS6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCTN3Q6NUS6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCTN3Q6NUS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCTN3Q6NUS6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCTN3Q6NUS6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCTN3Q6NUS6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCTN3Q6NUS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms