Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUS6

TCTN3, Tectonic-3, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN3Q6NUS6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TCTN3Q6NUS6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TCTN3Q6NUS6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TCTN3Q6NUS6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TCTN3Q6NUS6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TCTN3Q6NUS6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TCTN3Q6NUS6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
TCTN3Q6NUS6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TCTN3Q6NUS6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TCTN3Q6NUS6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TCTN3Q6NUS6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TCTN3Q6NUS6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TCTN3Q6NUS6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCTN3Q6NUS6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TCTN3Q6NUS6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCTN3Q6NUS6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCTN3Q6NUS6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCTN3Q6NUS6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCTN3Q6NUS6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCTN3Q6NUS6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCTN3Q6NUS6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCTN3Q6NUS6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TCTN3Q6NUS6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TCTN3Q6NUS6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCTN3Q6NUS6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TCTN3Q6NUS6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TCTN3Q6NUS6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TCTN3Q6NUS6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TCTN3Q6NUS6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TCTN3Q6NUS6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TCTN3Q6NUS6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCTN3Q6NUS6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TCTN3Q6NUS6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TCTN3Q6NUS6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TCTN3Q6NUS6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCTN3Q6NUS6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TCTN3Q6NUS6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCTN3Q6NUS6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCTN3Q6NUS6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCTN3Q6NUS6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TCTN3Q6NUS6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TCTN3Q6NUS6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TCTN3Q6NUS6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TCTN3Q6NUS6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCTN3Q6NUS6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCTN3Q6NUS6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TCTN3Q6NUS6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCTN3Q6NUS6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TCTN3Q6NUS6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TCTN3Q6NUS6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCTN3Q6NUS6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCTN3Q6NUS6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCTN3Q6NUS6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCTN3Q6NUS6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCTN3Q6NUS6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TCTN3Q6NUS6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCTN3Q6NUS6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCTN3Q6NUS6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TCTN3Q6NUS6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCTN3Q6NUS6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCTN3Q6NUS6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCTN3Q6NUS6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCTN3Q6NUS6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCTN3Q6NUS6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TCTN3Q6NUS6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCTN3Q6NUS6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCTN3Q6NUS6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCTN3Q6NUS6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCTN3Q6NUS6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCTN3Q6NUS6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCTN3Q6NUS6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TCTN3Q6NUS6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCTN3Q6NUS6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCTN3Q6NUS6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCTN3Q6NUS6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCTN3Q6NUS6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCTN3Q6NUS6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCTN3Q6NUS6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCTN3Q6NUS6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCTN3Q6NUS6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCTN3Q6NUS6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCTN3Q6NUS6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCTN3Q6NUS6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCTN3Q6NUS6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCTN3Q6NUS6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCTN3Q6NUS6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCTN3Q6NUS6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCTN3Q6NUS6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TCTN3Q6NUS6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCTN3Q6NUS6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCTN3Q6NUS6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCTN3Q6NUS6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCTN3Q6NUS6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCTN3Q6NUS6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCTN3Q6NUS6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCTN3Q6NUS6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCTN3Q6NUS6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TCTN3Q6NUS6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCTN3Q6NUS6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TCTN3Q6NUS6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms