Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SDE2Q6IQ49 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SDE2Q6IQ49 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SDE2Q6IQ49 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SDE2Q6IQ49 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDE2Q6IQ49 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDE2Q6IQ49 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SDE2Q6IQ49 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SDE2Q6IQ49 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDE2Q6IQ49 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDE2Q6IQ49 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDE2Q6IQ49 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms