Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LGALS9CQ6DKI2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LGALS9CQ6DKI2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LGALS9CQ6DKI2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LGALS9CQ6DKI2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LGALS9CQ6DKI2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGALS9CQ6DKI2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGALS9CQ6DKI2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms