Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARMC3Q5W041 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ARMC3Q5W041 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ARMC3Q5W041 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARMC3Q5W041 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ARMC3Q5W041 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ARMC3Q5W041 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ARMC3Q5W041 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARMC3Q5W041 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARMC3Q5W041 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARMC3Q5W041 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARMC3Q5W041 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARMC3Q5W041 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARMC3Q5W041 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ARMC3Q5W041 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARMC3Q5W041 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARMC3Q5W041 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARMC3Q5W041 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARMC3Q5W041 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARMC3Q5W041 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARMC3Q5W041 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARMC3Q5W041 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms