Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EEF1A1P5Q5VTE0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EEF1A1P5Q5VTE0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EEF1A1P5Q5VTE0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EEF1A1P5Q5VTE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EEF1A1P5Q5VTE0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EEF1A1P5Q5VTE0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EEF1A1P5Q5VTE0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EEF1A1P5Q5VTE0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms