Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
OBSCNQ5VST9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
OBSCNQ5VST9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
OBSCNQ5VST9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms