Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3BQ5T9A4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3BQ5T9A4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD3BQ5T9A4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD3BQ5T9A4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms