Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFAP70Q5T0N1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CFAP70Q5T0N1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFAP70Q5T0N1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms