Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CFAP70Q5T0N1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CFAP70Q5T0N1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
CFAP70Q5T0N1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CFAP70Q5T0N1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CFAP70Q5T0N1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CFAP70Q5T0N1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CFAP70Q5T0N1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CFAP70Q5T0N1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CFAP70Q5T0N1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CFAP70Q5T0N1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CFAP70Q5T0N1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
CFAP70Q5T0N1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CFAP70Q5T0N1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 369.8 ms