Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.37■■■■■ 5.49
CFAP70Q5T0N1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC48.3■■■■■ 5.32
CFAP70Q5T0N1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
CFAP70Q5T0N1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
CFAP70Q5T0N1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
CFAP70Q5T0N1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
CFAP70Q5T0N1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
CFAP70Q5T0N1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
CFAP70Q5T0N1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CFAP70Q5T0N1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
CFAP70Q5T0N1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
CFAP70Q5T0N1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CFAP70Q5T0N1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
CFAP70Q5T0N1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
CFAP70Q5T0N1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CFAP70Q5T0N1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
CFAP70Q5T0N1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.91
CFAP70Q5T0N1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
CFAP70Q5T0N1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CFAP70Q5T0N1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CFAP70Q5T0N1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
CFAP70Q5T0N1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CFAP70Q5T0N1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
CFAP70Q5T0N1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CFAP70Q5T0N1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
CFAP70Q5T0N1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
CFAP70Q5T0N1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
CFAP70Q5T0N1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
CFAP70Q5T0N1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.74
CFAP70Q5T0N1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
CFAP70Q5T0N1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
CFAP70Q5T0N1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CFAP70Q5T0N1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
CFAP70Q5T0N1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CFAP70Q5T0N1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
CFAP70Q5T0N1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CFAP70Q5T0N1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
CFAP70Q5T0N1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CFAP70Q5T0N1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
CFAP70Q5T0N1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
CFAP70Q5T0N1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
CFAP70Q5T0N1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
CFAP70Q5T0N1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CFAP70Q5T0N1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CFAP70Q5T0N1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CFAP70Q5T0N1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CFAP70Q5T0N1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CFAP70Q5T0N1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CFAP70Q5T0N1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CFAP70Q5T0N1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
CFAP70Q5T0N1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
CFAP70Q5T0N1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CFAP70Q5T0N1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CFAP70Q5T0N1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
CFAP70Q5T0N1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CFAP70Q5T0N1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
CFAP70Q5T0N1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CFAP70Q5T0N1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
CFAP70Q5T0N1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CFAP70Q5T0N1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CFAP70Q5T0N1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CFAP70Q5T0N1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CFAP70Q5T0N1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CFAP70Q5T0N1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CFAP70Q5T0N1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CFAP70Q5T0N1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CFAP70Q5T0N1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CFAP70Q5T0N1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CFAP70Q5T0N1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CFAP70Q5T0N1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CFAP70Q5T0N1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CFAP70Q5T0N1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CFAP70Q5T0N1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CFAP70Q5T0N1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CFAP70Q5T0N1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CFAP70Q5T0N1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CFAP70Q5T0N1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CFAP70Q5T0N1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CFAP70Q5T0N1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CFAP70Q5T0N1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
CFAP70Q5T0N1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CFAP70Q5T0N1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CFAP70Q5T0N1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CFAP70Q5T0N1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CFAP70Q5T0N1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CFAP70Q5T0N1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CFAP70Q5T0N1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CFAP70Q5T0N1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CFAP70Q5T0N1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CFAP70Q5T0N1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CFAP70Q5T0N1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CFAP70Q5T0N1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CFAP70Q5T0N1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CFAP70Q5T0N1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CFAP70Q5T0N1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CFAP70Q5T0N1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CFAP70Q5T0N1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CFAP70Q5T0N1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
CFAP70Q5T0N1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CFAP70Q5T0N1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms