Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C10orf55Q5SWW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C10orf55Q5SWW7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C10orf55Q5SWW7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C10orf55Q5SWW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C10orf55Q5SWW7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C10orf55Q5SWW7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C10orf55Q5SWW7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C10orf55Q5SWW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C10orf55Q5SWW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C10orf55Q5SWW7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C10orf55Q5SWW7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C10orf55Q5SWW7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C10orf55Q5SWW7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms