Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNAP47Q5SQN1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP47Q5SQN1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP47Q5SQN1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP47Q5SQN1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNAP47Q5SQN1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNAP47Q5SQN1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNAP47Q5SQN1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNAP47Q5SQN1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNAP47Q5SQN1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNAP47Q5SQN1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SNAP47Q5SQN1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SNAP47Q5SQN1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNAP47Q5SQN1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNAP47Q5SQN1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms