Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
COLEC12Q5KU26 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COLEC12Q5KU26 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
COLEC12Q5KU26 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COLEC12Q5KU26 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
COLEC12Q5KU26 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLEC12Q5KU26 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COLEC12Q5KU26 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLEC12Q5KU26 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COLEC12Q5KU26 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COLEC12Q5KU26 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COLEC12Q5KU26 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COLEC12Q5KU26 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COLEC12Q5KU26 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COLEC12Q5KU26 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms