Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
COLEC12Q5KU26 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
COLEC12Q5KU26 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
COLEC12Q5KU26 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
COLEC12Q5KU26 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
COLEC12Q5KU26 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
COLEC12Q5KU26 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
COLEC12Q5KU26 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
COLEC12Q5KU26 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
COLEC12Q5KU26 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
COLEC12Q5KU26 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
COLEC12Q5KU26 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
COLEC12Q5KU26 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
COLEC12Q5KU26 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
COLEC12Q5KU26 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
COLEC12Q5KU26 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
COLEC12Q5KU26 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
COLEC12Q5KU26 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
COLEC12Q5KU26 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
COLEC12Q5KU26 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
COLEC12Q5KU26 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
COLEC12Q5KU26 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
COLEC12Q5KU26 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
COLEC12Q5KU26 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
COLEC12Q5KU26 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
COLEC12Q5KU26 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
COLEC12Q5KU26 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
COLEC12Q5KU26 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
COLEC12Q5KU26 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
COLEC12Q5KU26 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COLEC12Q5KU26 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COLEC12Q5KU26 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COLEC12Q5KU26 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COLEC12Q5KU26 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COLEC12Q5KU26 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COLEC12Q5KU26 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COLEC12Q5KU26 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COLEC12Q5KU26 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COLEC12Q5KU26 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COLEC12Q5KU26 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COLEC12Q5KU26 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COLEC12Q5KU26 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COLEC12Q5KU26 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COLEC12Q5KU26 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COLEC12Q5KU26 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COLEC12Q5KU26 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COLEC12Q5KU26 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COLEC12Q5KU26 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COLEC12Q5KU26 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COLEC12Q5KU26 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
COLEC12Q5KU26 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COLEC12Q5KU26 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COLEC12Q5KU26 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COLEC12Q5KU26 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COLEC12Q5KU26 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COLEC12Q5KU26 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COLEC12Q5KU26 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COLEC12Q5KU26 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
COLEC12Q5KU26 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COLEC12Q5KU26 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COLEC12Q5KU26 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLEC12Q5KU26 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COLEC12Q5KU26 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COLEC12Q5KU26 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
COLEC12Q5KU26 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLEC12Q5KU26 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COLEC12Q5KU26 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COLEC12Q5KU26 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COLEC12Q5KU26 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COLEC12Q5KU26 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COLEC12Q5KU26 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COLEC12Q5KU26 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COLEC12Q5KU26 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COLEC12Q5KU26 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COLEC12Q5KU26 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COLEC12Q5KU26 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COLEC12Q5KU26 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COLEC12Q5KU26 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COLEC12Q5KU26 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COLEC12Q5KU26 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COLEC12Q5KU26 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COLEC12Q5KU26 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COLEC12Q5KU26 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COLEC12Q5KU26 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COLEC12Q5KU26 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COLEC12Q5KU26 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COLEC12Q5KU26 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COLEC12Q5KU26 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COLEC12Q5KU26 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COLEC12Q5KU26 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COLEC12Q5KU26 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COLEC12Q5KU26 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COLEC12Q5KU26 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COLEC12Q5KU26 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
COLEC12Q5KU26 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COLEC12Q5KU26 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COLEC12Q5KU26 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COLEC12Q5KU26 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COLEC12Q5KU26 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms