Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXC2

MIIP, Migration and invasion-inhibitory protein, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIIPQ5JXC2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MIIPQ5JXC2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MIIPQ5JXC2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MIIPQ5JXC2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MIIPQ5JXC2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MIIPQ5JXC2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MIIPQ5JXC2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MIIPQ5JXC2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MIIPQ5JXC2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MIIPQ5JXC2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MIIPQ5JXC2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MIIPQ5JXC2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MIIPQ5JXC2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
MIIPQ5JXC2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIIPQ5JXC2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MIIPQ5JXC2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MIIPQ5JXC2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MIIPQ5JXC2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MIIPQ5JXC2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MIIPQ5JXC2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms