Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZC3H12AQ5D1E8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZC3H12AQ5D1E8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZC3H12AQ5D1E8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC3H12AQ5D1E8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZC3H12AQ5D1E8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12AQ5D1E8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZC3H12AQ5D1E8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZC3H12AQ5D1E8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZC3H12AQ5D1E8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ZC3H12AQ5D1E8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12AQ5D1E8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZC3H12AQ5D1E8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZC3H12AQ5D1E8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZC3H12AQ5D1E8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZC3H12AQ5D1E8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZC3H12AQ5D1E8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZC3H12AQ5D1E8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZC3H12AQ5D1E8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZC3H12AQ5D1E8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZC3H12AQ5D1E8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZC3H12AQ5D1E8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms