Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF8

HSP90AB2P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB2PQ58FF8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HSP90AB2PQ58FF8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HSP90AB2PQ58FF8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HSP90AB2PQ58FF8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HSP90AB2PQ58FF8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HSP90AB2PQ58FF8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HSP90AB2PQ58FF8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HSP90AB2PQ58FF8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HSP90AB2PQ58FF8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
HSP90AB2PQ58FF8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HSP90AB2PQ58FF8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
HSP90AB2PQ58FF8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HSP90AB2PQ58FF8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HSP90AB2PQ58FF8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HSP90AB2PQ58FF8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HSP90AB2PQ58FF8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HSP90AB2PQ58FF8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HSP90AB2PQ58FF8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HSP90AB2PQ58FF8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HSP90AB2PQ58FF8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HSP90AB2PQ58FF8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HSP90AB2PQ58FF8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
HSP90AB2PQ58FF8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
HSP90AB2PQ58FF8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
HSP90AB2PQ58FF8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
HSP90AB2PQ58FF8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
HSP90AB2PQ58FF8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms