Protein–RNA interactions for Protein: Q32P44

EML3, Echinoderm microtubule-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EML3Q32P44 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EML3Q32P44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EML3Q32P44 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EML3Q32P44 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EML3Q32P44 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EML3Q32P44 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EML3Q32P44 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EML3Q32P44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EML3Q32P44 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EML3Q32P44 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EML3Q32P44 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EML3Q32P44 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EML3Q32P44 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EML3Q32P44 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EML3Q32P44 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EML3Q32P44 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EML3Q32P44 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EML3Q32P44 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EML3Q32P44 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms