Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRNQ16849 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRNQ16849 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRNQ16849 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPRNQ16849 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRNQ16849 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRNQ16849 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRNQ16849 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRNQ16849 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRNQ16849 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRNQ16849 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRNQ16849 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRNQ16849 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRNQ16849 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRNQ16849 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRNQ16849 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRNQ16849 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRNQ16849 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRNQ16849 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRNQ16849 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRNQ16849 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRNQ16849 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRNQ16849 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
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PTPRNQ16849 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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PTPRNQ16849 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRNQ16849 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRNQ16849 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRNQ16849 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
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