Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEP1BQ16820 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEP1BQ16820 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEP1BQ16820 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEP1BQ16820 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MEP1BQ16820 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEP1BQ16820 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MEP1BQ16820 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MEP1BQ16820 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MEP1BQ16820 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEP1BQ16820 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms