Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NREPQ16612 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NREPQ16612 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NREPQ16612 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NREPQ16612 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NREPQ16612 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NREPQ16612 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NREPQ16612 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NREPQ16612 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NREPQ16612 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NREPQ16612 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NREPQ16612 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NREPQ16612 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NREPQ16612 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NREPQ16612 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NREPQ16612 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NREPQ16612 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NREPQ16612 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NREPQ16612 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NREPQ16612 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NREPQ16612 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NREPQ16612 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NREPQ16612 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NREPQ16612 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NREPQ16612 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NREPQ16612 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NREPQ16612 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NREPQ16612 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NREPQ16612 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NREPQ16612 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NREPQ16612 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NREPQ16612 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NREPQ16612 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NREPQ16612 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NREPQ16612 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NREPQ16612 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NREPQ16612 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NREPQ16612 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NREPQ16612 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NREPQ16612 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NREPQ16612 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NREPQ16612 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NREPQ16612 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NREPQ16612 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NREPQ16612 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NREPQ16612 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NREPQ16612 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NREPQ16612 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NREPQ16612 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NREPQ16612 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NREPQ16612 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NREPQ16612 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NREPQ16612 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NREPQ16612 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NREPQ16612 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NREPQ16612 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NREPQ16612 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NREPQ16612 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NREPQ16612 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NREPQ16612 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NREPQ16612 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NREPQ16612 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NREPQ16612 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NREPQ16612 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NREPQ16612 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NREPQ16612 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NREPQ16612 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NREPQ16612 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NREPQ16612 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NREPQ16612 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NREPQ16612 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NREPQ16612 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NREPQ16612 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NREPQ16612 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NREPQ16612 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NREPQ16612 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NREPQ16612 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NREPQ16612 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NREPQ16612 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NREPQ16612 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NREPQ16612 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NREPQ16612 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NREPQ16612 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NREPQ16612 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NREPQ16612 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NREPQ16612 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NREPQ16612 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NREPQ16612 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NREPQ16612 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NREPQ16612 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NREPQ16612 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NREPQ16612 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NREPQ16612 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NREPQ16612 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NREPQ16612 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NREPQ16612 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NREPQ16612 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NREPQ16612 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NREPQ16612 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NREPQ16612 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms