Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SGCBQ16585 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGCBQ16585 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGCBQ16585 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCBQ16585 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGCBQ16585 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGCBQ16585 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGCBQ16585 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SGCBQ16585 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SGCBQ16585 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCBQ16585 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCBQ16585 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCBQ16585 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCBQ16585 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCBQ16585 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCBQ16585 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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