Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SGCBQ16585 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SGCBQ16585 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SGCBQ16585 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SGCBQ16585 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SGCBQ16585 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SGCBQ16585 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SGCBQ16585 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SGCBQ16585 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SGCBQ16585 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SGCBQ16585 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SGCBQ16585 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SGCBQ16585 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SGCBQ16585 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SGCBQ16585 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGCBQ16585 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGCBQ16585 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGCBQ16585 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGCBQ16585 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SGCBQ16585 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SGCBQ16585 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SGCBQ16585 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SGCBQ16585 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SGCBQ16585 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SGCBQ16585 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SGCBQ16585 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SGCBQ16585 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SGCBQ16585 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SGCBQ16585 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SGCBQ16585 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGCBQ16585 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGCBQ16585 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGCBQ16585 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGCBQ16585 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGCBQ16585 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGCBQ16585 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGCBQ16585 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGCBQ16585 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGCBQ16585 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SGCBQ16585 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGCBQ16585 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGCBQ16585 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGCBQ16585 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SGCBQ16585 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGCBQ16585 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGCBQ16585 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGCBQ16585 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGCBQ16585 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGCBQ16585 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGCBQ16585 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGCBQ16585 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGCBQ16585 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SGCBQ16585 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SGCBQ16585 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGCBQ16585 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGCBQ16585 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGCBQ16585 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGCBQ16585 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGCBQ16585 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGCBQ16585 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SGCBQ16585 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGCBQ16585 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGCBQ16585 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SGCBQ16585 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SGCBQ16585 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SGCBQ16585 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGCBQ16585 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SGCBQ16585 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGCBQ16585 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SGCBQ16585 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SGCBQ16585 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SGCBQ16585 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SGCBQ16585 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SGCBQ16585 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SGCBQ16585 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGCBQ16585 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SGCBQ16585 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SGCBQ16585 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGCBQ16585 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SGCBQ16585 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SGCBQ16585 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGCBQ16585 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SGCBQ16585 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGCBQ16585 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGCBQ16585 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGCBQ16585 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGCBQ16585 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGCBQ16585 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGCBQ16585 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGCBQ16585 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGCBQ16585 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGCBQ16585 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGCBQ16585 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGCBQ16585 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGCBQ16585 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGCBQ16585 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGCBQ16585 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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