Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB1Q16558 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMB1Q16558 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMB1Q16558 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB1Q16558 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB1Q16558 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMB1Q16558 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMB1Q16558 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMB1Q16558 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNMB1Q16558 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNMB1Q16558 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB1Q16558 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB1Q16558 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNMB1Q16558 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
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