Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIP4Q15650 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIP4Q15650 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIP4Q15650 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIP4Q15650 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIP4Q15650 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIP4Q15650 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIP4Q15650 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRIP4Q15650 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIP4Q15650 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIP4Q15650 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIP4Q15650 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIP4Q15650 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIP4Q15650 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIP4Q15650 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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