Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPAQ15257 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPAQ15257 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPAQ15257 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPAQ15257 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPAQ15257 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPAQ15257 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPAQ15257 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPAQ15257 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPAQ15257 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPAQ15257 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPAQ15257 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPAQ15257 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPAQ15257 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPAQ15257 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PTPAQ15257 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PTPAQ15257 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PTPAQ15257 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPAQ15257 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPAQ15257 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPAQ15257 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PTPAQ15257 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPAQ15257 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPAQ15257 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PTPAQ15257 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PTPAQ15257 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PTPAQ15257 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPAQ15257 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PTPAQ15257 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PTPAQ15257 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPAQ15257 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPAQ15257 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPAQ15257 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPAQ15257 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPAQ15257 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
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