Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCF4Q15080 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NCF4Q15080 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCF4Q15080 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCF4Q15080 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NCF4Q15080 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCF4Q15080 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCF4Q15080 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCF4Q15080 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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