Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HNF4GQ14541 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HNF4GQ14541 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HNF4GQ14541 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HNF4GQ14541 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HNF4GQ14541 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HNF4GQ14541 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HNF4GQ14541 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms