Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PEX6Q13608 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PEX6Q13608 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PEX6Q13608 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX6Q13608 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX6Q13608 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PEX6Q13608 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PEX6Q13608 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PEX6Q13608 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PEX6Q13608 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PEX6Q13608 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PEX6Q13608 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX6Q13608 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX6Q13608 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PEX6Q13608 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PEX6Q13608 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PEX6Q13608 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PEX6Q13608 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
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