Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C1orf61Q13536 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
C1orf61Q13536 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
C1orf61Q13536 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1orf61Q13536 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
C1orf61Q13536 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1orf61Q13536 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C1orf61Q13536 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C1orf61Q13536 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf61Q13536 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C1orf61Q13536 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
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