Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
C1orf61Q13536 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
C1orf61Q13536 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
C1orf61Q13536 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
C1orf61Q13536 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
C1orf61Q13536 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
C1orf61Q13536 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
C1orf61Q13536 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
C1orf61Q13536 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
C1orf61Q13536 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
C1orf61Q13536 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
C1orf61Q13536 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
C1orf61Q13536 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
C1orf61Q13536 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
C1orf61Q13536 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
C1orf61Q13536 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
C1orf61Q13536 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
C1orf61Q13536 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
C1orf61Q13536 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
C1orf61Q13536 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
C1orf61Q13536 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
C1orf61Q13536 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
C1orf61Q13536 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
C1orf61Q13536 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
C1orf61Q13536 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
C1orf61Q13536 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
C1orf61Q13536 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
C1orf61Q13536 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
C1orf61Q13536 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
C1orf61Q13536 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
C1orf61Q13536 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
C1orf61Q13536 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
C1orf61Q13536 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
C1orf61Q13536 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
C1orf61Q13536 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
C1orf61Q13536 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
C1orf61Q13536 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
C1orf61Q13536 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
C1orf61Q13536 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
C1orf61Q13536 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
C1orf61Q13536 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
C1orf61Q13536 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
C1orf61Q13536 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
C1orf61Q13536 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
C1orf61Q13536 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
C1orf61Q13536 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
C1orf61Q13536 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
C1orf61Q13536 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
C1orf61Q13536 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
C1orf61Q13536 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
C1orf61Q13536 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C1orf61Q13536 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C1orf61Q13536 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C1orf61Q13536 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C1orf61Q13536 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C1orf61Q13536 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C1orf61Q13536 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf61Q13536 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C1orf61Q13536 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C1orf61Q13536 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C1orf61Q13536 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
C1orf61Q13536 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C1orf61Q13536 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
C1orf61Q13536 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
C1orf61Q13536 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C1orf61Q13536 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C1orf61Q13536 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C1orf61Q13536 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C1orf61Q13536 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C1orf61Q13536 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
C1orf61Q13536 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C1orf61Q13536 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1orf61Q13536 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C1orf61Q13536 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C1orf61Q13536 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C1orf61Q13536 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C1orf61Q13536 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C1orf61Q13536 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C1orf61Q13536 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C1orf61Q13536 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C1orf61Q13536 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C1orf61Q13536 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C1orf61Q13536 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C1orf61Q13536 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C1orf61Q13536 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C1orf61Q13536 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C1orf61Q13536 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C1orf61Q13536 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C1orf61Q13536 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C1orf61Q13536 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C1orf61Q13536 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
C1orf61Q13536 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C1orf61Q13536 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C1orf61Q13536 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C1orf61Q13536 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1orf61Q13536 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1orf61Q13536 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
C1orf61Q13536 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1orf61Q13536 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1orf61Q13536 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
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