Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRPF4BQ13523 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRPF4BQ13523 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRPF4BQ13523 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF4BQ13523 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF4BQ13523 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PRPF4BQ13523 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF4BQ13523 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF4BQ13523 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRPF4BQ13523 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PRPF4BQ13523 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRPF4BQ13523 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPF4BQ13523 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRPF4BQ13523 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF4BQ13523 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF4BQ13523 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRPF4BQ13523 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
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