Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
DDX10Q13206 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
DDX10Q13206 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DDX10Q13206 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
DDX10Q13206 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DDX10Q13206 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
DDX10Q13206 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DDX10Q13206 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
DDX10Q13206 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
DDX10Q13206 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
DDX10Q13206 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
DDX10Q13206 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
DDX10Q13206 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
DDX10Q13206 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
DDX10Q13206 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
DDX10Q13206 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
DDX10Q13206 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
DDX10Q13206 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
DDX10Q13206 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
DDX10Q13206 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
DDX10Q13206 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
DDX10Q13206 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
DDX10Q13206 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DDX10Q13206 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
DDX10Q13206 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
DDX10Q13206 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
DDX10Q13206 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
DDX10Q13206 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
DDX10Q13206 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
DDX10Q13206 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.58
DDX10Q13206 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
DDX10Q13206 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
DDX10Q13206 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
DDX10Q13206 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
DDX10Q13206 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DDX10Q13206 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DDX10Q13206 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
DDX10Q13206 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
DDX10Q13206 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
DDX10Q13206 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DDX10Q13206 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
DDX10Q13206 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
DDX10Q13206 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DDX10Q13206 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DDX10Q13206 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
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