Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPA4Q13156 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA4Q13156 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA4Q13156 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA4Q13156 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA4Q13156 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA4Q13156 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA4Q13156 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA4Q13156 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA4Q13156 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA4Q13156 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPA4Q13156 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA4Q13156 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA4Q13156 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPA4Q13156 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RPA4Q13156 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
RPA4Q13156 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPA4Q13156 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RPA4Q13156 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA4Q13156 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA4Q13156 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA4Q13156 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA4Q13156 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPA4Q13156 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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