Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PPFIA1Q13136 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA1Q13136 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA1Q13136 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA1Q13136 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPFIA1Q13136 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPFIA1Q13136 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPFIA1Q13136 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PPFIA1Q13136 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PPFIA1Q13136 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PPFIA1Q13136 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PPFIA1Q13136 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PPFIA1Q13136 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIA1Q13136 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PPFIA1Q13136 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIA1Q13136 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIA1Q13136 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PPFIA1Q13136 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PPFIA1Q13136 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PPFIA1Q13136 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PPFIA1Q13136 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PPFIA1Q13136 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms