Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ECH1Q13011 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ECH1Q13011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECH1Q13011 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECH1Q13011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ECH1Q13011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ECH1Q13011 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ECH1Q13011 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECH1Q13011 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECH1Q13011 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms