Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSTF3Q12996 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSTF3Q12996 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CSTF3Q12996 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSTF3Q12996 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSTF3Q12996 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSTF3Q12996 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSTF3Q12996 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CSTF3Q12996 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CSTF3Q12996 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CSTF3Q12996 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSTF3Q12996 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSTF3Q12996 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSTF3Q12996 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CSTF3Q12996 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CSTF3Q12996 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSTF3Q12996 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSTF3Q12996 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSTF3Q12996 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSTF3Q12996 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSTF3Q12996 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSTF3Q12996 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSTF3Q12996 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms