Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms