Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SFSWAPQ12872 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SFSWAPQ12872 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SFSWAPQ12872 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SFSWAPQ12872 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFSWAPQ12872 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SFSWAPQ12872 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFSWAPQ12872 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFSWAPQ12872 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
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